CZ | EN

Metabolomics as a tool illustrating the interactions between a plant and its microbiome

Metabolomika jako nástroj ilustrující interakce mezi rostlinou a její mikrobiotou

Metabolomics as a tool illustrating the interactions between a plant and its microbiome

Metabolomika jako nástroj ilustrující interakce mezi rostlinou a její mikrobiotou

ANOTACE

Mikrobiální konsorcia přítomná na zemědělských rostlinách mají zásadní vliv na jejich prosperitu (růst, odolnost vůči patogenům, úrodu, chemické složení, atd.). Významnou roli hraje jak samotný mikrobiální druh osídlující rostlinu (bakterie, mikromycety, kvasinky), tak i vzájemný vztah mikroorganismu a rostliny (endofyt vs. patogen). Téma disertační práce bude zahrnovat charakteristiku (bio)chemických změn probíhajících v systému rostlin a mikroorganismů pomocí metabolomiky, jakožto komplexní analýzy endogenních a exogenních metabolitů s nízkou molekulovou hmotností do přibližně 1500 Da, realizované pomocí moderních technik ultra-účinné kapalinové chromatografie a vysokorozlišovací hmotnostní spektrometrie. Pozornost bude zaměřena na Vitis vinifera L. (réva vinná) a Hordeum vulgare L. (je

ANNOTATION

Microbial consortia present on agricultural plants have a major impact on their prosperity (growth, resistance to pathogens, yields, chemical composition, etc.). An important role is played by the microbial species inhabiting the plant itself (bacteria, micromycetes, yeast), as well as the relationship between the microorganism and the plant (endophyte vs. pathogen). The topic of the dissertation will include the characterization of (bio)chemical changes taking place in the system of plants and microorganisms using metabolomics, as a complex analysis of endogenous and exogenous metabolites with low molecular weight up to about 1500 Da. Attention will be focused on Vitis vinifera L. (vine) and Hordeum vulgare L. (sown barley), as one of the most important agricultural plants grown in the Czech Republic.