UCT Repository Prague MASTER THESIS

Studium inhibice rekombinantních virových polymeráz malými molekulami

Inhibition of recombinant viral polymerases by small molecules

Bc. Lucie Pravdová

UCT Repository Prague MASTER THESIS

Studium inhibice rekombinantních virových polymeráz malými molekulami

Inhibition of recombinant viral polymerases by small molecules

Bc. Lucie Pravdová

Klíčový enzym pro replikaci všech RNA virů je RNA dependentní RNA polymeráza (RdRp). Jedním z virových onemocnění v České republice, na které není dostupná žádná specifická terapie je klíšťová encafalitida, kterou způsobuje RNA virus klíšťové encefalitidy z rodiny flavivirů. Cílem této práce bylo vyzkoušet vliv několika potencionálních inhibitorů na aktivitu RdRp enzymu z viru klíšťové encefalitidy. Jako potenciální inhibitory byla vybrána analoga adenosin trifosfátu (ATP). Enzym byl připraven rekombinantně s využitím E. coli expresního systému, dále byl izolován a purifikován. Byly nalezeny vhodné podmínky pro in vitro polymerázovou reakci katalyzovanou RdRp. Následně byl testován vliv těchto ATP analogů na průběh reakce.

A key enzyme for the replication of RNA viruses is the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp). Tick-borne encephalitis is a quite common viral disease in Czech Republic that is caused by the thick-borne encephalitis RNA virus from the Flaviviridea family. Unfortunaltelly, no approved therapy exists. In this study, we tested the effect of several potential inhibitors on the activity of its RdRp. Several analogs of adenosine triphosphate (ATP) were selected for testing. The recombinant enzyme was prepared using the E.coli expression system, then it was isolated and purified. Next, optimal conditions for the polymerase reaction were found. Finally, the influence of the ATP analogs on the reaction was tested.

Advisor: prof. Ing. Martin Fusek, CSc.
Mgr. et Mgr. Evžen Bouřa, Ph.D.
Referee: doc. Ing. Pavel Ulbrich, Ph.D.
Thesis type: Master thesis
Institution: University of Chemistry and Technology, Prague
Faculty: Faculty of Food and Biochemical Technology
Department: Department of Biochemistry and Microbiology
Institution: Institute of Organic Chemistry and Biochemistry of the CAS, v. v. i.
Study programme: General and Applied Biochemistry
Specialization / field: Biochemistry and Biotechnology
MŠMT code: 2810T003
Language: Czech
Access rights: open access
SIS ID: 28846
Date available: Jun 22, 2020
Date modified: Jun 23, 2020
Date defended: Jun 8, 2020DEFENDED

Studium inhibice rekombinantních virových polymeráz malými molekulami

Inhibition of recombinant viral polymerases by small molecules

Studium inhibice rekombinantních virových polymeráz malými molekulami

Inhibition of recombinant viral polymerases by small molecules

ANOTACE

ANNOTATION