UCT Repository Prague DOCTORAL THESIS

Data mining in chemical biology

Metody vytěžování znalostí z dat v chemické biologii

Ing. Ctibor Škuta, Ph.D.

UCT Repository Prague DOCTORAL THESIS

Data mining in chemical biology

Metody vytěžování znalostí z dat v chemické biologii

Ing. Ctibor Škuta, Ph.D.

Chemická biologie je vědeckou oblastí zabývající se studiem biologických systémů za použití chemických postupů. Hlavními aplikačními oblastmi chemické biologie jsou návrh léčiv a vývoj technik a nástrojů (obvykle syntetických organických sloučenin) sloužících ke zkoumání biologických systémů. Klíčovou experimentální metodou chemické biologie je vysoce propustné testování (high-throughput screening HTS), které umožňuje v krátkém časovém rozmezí velmi efektivně provádět tisíce biologických testů. Práce je zaměřena na aplikaci pokročilých statistických postupů, metod vytěžování znalostí z dat a cheminformatických přístupů pro hledání vztahů a zákonitostí v HTS datech a na jejich chemickou a biologickou interpretaci.

Chemical biology is a scientific discipline that attempts to answer biological questions by directly probing living systems at the chemical level. The main application areas of chemical biology are the drug design, and the development of techniques and tools (usually synthetic organic compounds) for studying biological systems. The key experimental method used in chemical biology is the high-throughput screening (HTS) allowing to quickly conduct thousands of various biological tests. The dissertation is focused on the application of advanced statistical, and data mining methods combined with cheminformatics approaches to the searching of natural relations in HTS data, and to their chemically and biologically meaningful interpretation.

Advisor: prof. Mgr. Daniel Svozil, Ph.D.
RNDr. Petr Bartůněk, CSc.
RNDr. Petr Bartůněk, CSc.
Thesis type: Doctoral thesis
Institution: University of Chemistry and Technology, Prague
Faculty: Faculty of Chemical Technology
Department: Department of Informatics and Chemistry
Study programme: Drugs and Biomaterials
Specialization / field: Synthesis and Production of Drugs
MŠMT code: 2801V024
Language: English
Access rights: open access
SIS ID: 13964
Date available: Sep 27, 2018
Date modified: Sep 27, 2018
Date defended: Sep 13, 2018DEFENDED

Data mining in chemical biology

Metody vytěžování znalostí z dat v chemické biologii

Data mining in chemical biology

Metody vytěžování znalostí z dat v chemické biologii

ANOTACE

ANNOTATION